Коренные зубы имеют строение, характерное для серых полевок. На внутренней стороне /m1 четыре хорошо выраженных входящих угла, а на внешней - три. На головке антероконидного комплекса начинают формироваться последующие входящие углы, причем в большинстве случаев внутренний входящий угол выражен гораздо сильнее наружного. В целом рисунок жевательной поверхности моляров зверьков этой группы обладает промежуточными чертами между морфотипами группы «arvalis», группы «gregalis» и продвинутыми морфотипами "oeconomus". В отличии от узкочерепных полевок - входящий угол на буккальной стороне антероконида (BRA3) закрыт «нависающей» гранью BSA4.

Зубы ископаемых западносибирских полевок M. (A.) ex gr. middendorffii-hyperboreus могут быть разделены на две группы морфотипов: в группу морфотипов «hyperboreus» (Смирнов, Большаков, Бородин, 1986) отнесены моляры, соответствующие описаниям А.К. Агаджаняна (1982). Для них характерна узкая нерасширяющаяся передняя доля антероконида, значительно оттянутый назад наружный треугольник параконида; в группу морфотипов «middendorffii» отнесены моляры с рисунком жевательной поверхности, встречающейся у современных полевок Миддендорфа. Моляры этой группы по форме в большинстве случаев имеют промежуточные черты между морфотипами групп «arvalis-agrestis» и «gregalis». Одним из отличий «грегалисных» морфотипов /m1 полевки Миддендорфа от одноименных моляров узкочерепной полевки является форма переднего наружного входящего угла. Для М. middendorffi характерен более плавный излом его режущей эмалевой стенки, а дентиновое поле головки антероконидного отдела заходит за вершину входящего угла.  

Коренные зубы полевок, подобные вышеописанным, хорошо известны из средне- и поздненеоплейстоценовых отложений Якутии, Чукотки, Западной Сибири, Русской равнины и Западной Европы (Агаджанян, 1980; Агаджанян, Ербаева, 1983; Маркова, 1980), где встречаются в составе «лемминговых фаун». В нижнеобских местонахождениях она встречается совместно с леммингами и узкочерепной полевкой, что характерно и для современной тундровой териофауны, а в нижнеиртышских местонахождениях она входит в состав «лемминговых фаун», которые могут интерпретироваться как лесотундровые или тундролесостепные. Изменение ареала полевки Миддендорфа в четвертичном периоде совпадает с изменением границ распространения копытных и настоящих леммингов.